Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms