Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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RNF7Q9UBF6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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RNF7Q9UBF6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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RNF7Q9UBF6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
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