Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms