Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms