Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms