Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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