Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV6

CDKN2AIP, CDKN2A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AIPQ9NXV6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN2AIPQ9NXV6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDKN2AIPQ9NXV6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDKN2AIPQ9NXV6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDKN2AIPQ9NXV6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN2AIPQ9NXV6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN2AIPQ9NXV6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN2AIPQ9NXV6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN2AIPQ9NXV6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN2AIPQ9NXV6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN2AIPQ9NXV6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN2AIPQ9NXV6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN2AIPQ9NXV6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN2AIPQ9NXV6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN2AIPQ9NXV6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN2AIPQ9NXV6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN2AIPQ9NXV6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN2AIPQ9NXV6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN2AIPQ9NXV6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN2AIPQ9NXV6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN2AIPQ9NXV6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN2AIPQ9NXV6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN2AIPQ9NXV6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN2AIPQ9NXV6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN2AIPQ9NXV6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN2AIPQ9NXV6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN2AIPQ9NXV6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKN2AIPQ9NXV6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKN2AIPQ9NXV6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKN2AIPQ9NXV6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKN2AIPQ9NXV6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKN2AIPQ9NXV6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKN2AIPQ9NXV6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKN2AIPQ9NXV6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKN2AIPQ9NXV6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms