Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CWC25Q9NXE8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms