Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
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