Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms