Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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CYLDQ9NQC7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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CYLDQ9NQC7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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