Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms