Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms