Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms