Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRDM12Q9H4Q4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRDM12Q9H4Q4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRDM12Q9H4Q4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRDM12Q9H4Q4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRDM12Q9H4Q4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRDM12Q9H4Q4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRDM12Q9H4Q4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRDM12Q9H4Q4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRDM12Q9H4Q4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRDM12Q9H4Q4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRDM12Q9H4Q4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRDM12Q9H4Q4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRDM12Q9H4Q4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRDM12Q9H4Q4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PRDM12Q9H4Q4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRDM12Q9H4Q4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRDM12Q9H4Q4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRDM12Q9H4Q4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRDM12Q9H4Q4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PRDM12Q9H4Q4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PRDM12Q9H4Q4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRDM12Q9H4Q4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRDM12Q9H4Q4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRDM12Q9H4Q4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRDM12Q9H4Q4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms