Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NYXQ9GZU5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NYXQ9GZU5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms