Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms