Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTR3CQ9C0K3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms