Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms