Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms