Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms