Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms