Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms