Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC7Q96NW7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms