Protein–RNA interactions for Protein: Q96NE9

FRMD6, FERM domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD6Q96NE9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FRMD6Q96NE9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FRMD6Q96NE9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms