Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX3

ZNF48, Zinc finger protein 48, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF48Q96MX3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms