Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF4Q96M43 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms