Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms