Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC59Q96AG4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC59Q96AG4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC59Q96AG4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC59Q96AG4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC59Q96AG4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC59Q96AG4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC59Q96AG4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms