Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNRQ92752 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNRQ92752 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TNRQ92752 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNRQ92752 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNRQ92752 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNRQ92752 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNRQ92752 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNRQ92752 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNRQ92752 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNRQ92752 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNRQ92752 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNRQ92752 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TNRQ92752 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNRQ92752 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNRQ92752 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNRQ92752 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNRQ92752 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TNRQ92752 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNRQ92752 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNRQ92752 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNRQ92752 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TNRQ92752 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNRQ92752 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNRQ92752 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNRQ92752 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNRQ92752 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNRQ92752 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNRQ92752 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNRQ92752 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNRQ92752 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNRQ92752 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNRQ92752 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNRQ92752 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNRQ92752 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNRQ92752 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNRQ92752 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNRQ92752 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNRQ92752 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNRQ92752 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNRQ92752 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNRQ92752 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNRQ92752 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNRQ92752 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TNRQ92752 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNRQ92752 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TNRQ92752 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TNRQ92752 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TNRQ92752 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TNRQ92752 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNRQ92752 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNRQ92752 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNRQ92752 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNRQ92752 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNRQ92752 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNRQ92752 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNRQ92752 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TNRQ92752 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNRQ92752 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNRQ92752 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TNRQ92752 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TNRQ92752 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNRQ92752 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNRQ92752 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNRQ92752 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TNRQ92752 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNRQ92752 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNRQ92752 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNRQ92752 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNRQ92752 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNRQ92752 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNRQ92752 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNRQ92752 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNRQ92752 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNRQ92752 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNRQ92752 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNRQ92752 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNRQ92752 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNRQ92752 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TNRQ92752 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNRQ92752 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNRQ92752 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNRQ92752 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNRQ92752 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNRQ92752 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNRQ92752 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNRQ92752 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNRQ92752 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNRQ92752 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNRQ92752 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNRQ92752 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNRQ92752 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TNRQ92752 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TNRQ92752 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TNRQ92752 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNRQ92752 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNRQ92752 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNRQ92752 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TNRQ92752 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TNRQ92752 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms