Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TOPBP1Q92547 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
TOPBP1Q92547 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TOPBP1Q92547 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
TOPBP1Q92547 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TOPBP1Q92547 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms