Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms