Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM8

AGBL3, Cytosolic carboxypeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL3Q8NEM8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGBL3Q8NEM8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AGBL3Q8NEM8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AGBL3Q8NEM8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AGBL3Q8NEM8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AGBL3Q8NEM8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AGBL3Q8NEM8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGBL3Q8NEM8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGBL3Q8NEM8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGBL3Q8NEM8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGBL3Q8NEM8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGBL3Q8NEM8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms