Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF439Q8NDP4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms