Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HJURPQ8NCD3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms