Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms