Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G2

CMTR1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTR1Q8N1G2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CMTR1Q8N1G2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CMTR1Q8N1G2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CMTR1Q8N1G2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CMTR1Q8N1G2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CMTR1Q8N1G2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CMTR1Q8N1G2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CMTR1Q8N1G2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CMTR1Q8N1G2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTR1Q8N1G2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms