Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP4Q86YS3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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