Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms