Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms