Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms