Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q71RC1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q71RC1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q71RC1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q71RC1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q71RC1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q71RC1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q71RC1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q71RC1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q71RC1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q71RC1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q71RC1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q71RC1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q71RC1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q71RC1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q71RC1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q71RC1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q71RC1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q71RC1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q71RC1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q71RC1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q71RC1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q71RC1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q71RC1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q71RC1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q71RC1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q71RC1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q71RC1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q71RC1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q71RC1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q71RC1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q71RC1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q71RC1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms