Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms