Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms