Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms