Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNE3Q6ZMZ3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNE3Q6ZMZ3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNE3Q6ZMZ3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNE3Q6ZMZ3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNE3Q6ZMZ3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNE3Q6ZMZ3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNE3Q6ZMZ3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNE3Q6ZMZ3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNE3Q6ZMZ3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNE3Q6ZMZ3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNE3Q6ZMZ3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNE3Q6ZMZ3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNE3Q6ZMZ3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNE3Q6ZMZ3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNE3Q6ZMZ3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNE3Q6ZMZ3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNE3Q6ZMZ3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms