Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
WDR88Q6ZMY6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms