Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms