Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP5Q6NZY7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms