Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms